iДНК-ПЛЕМстат версия_1.24.11
Из лучшего делать лучшее
Секвенирование и фрагментный анализ
Универсальность подхода
Секвенирование генома сегодня осуществляется в основном методами высокоэффективного секвенирования на системах Illumina, BGI/MSI, Ion TermoFisher (США) вышеуказанных платформах, в то время как секвенирование контрольных образцов, положительных контрольных образоцв, созданных на основе генетических плазмидных векторов, осуществляется классическим секвенированием в капиллярном электрофорезе на платформах Beckman Coulter и Termo Fisher (ABI) (США). В первом случае, проводится мультиплексная амплификация и обогащение целевых участков генома, а затем секвенирование, либо геном фрагментируется ферментативно и, после подготовки библиотек и штих-кодирования образцов (генетически через легирование с полинуклеотидами), а далее секвенируется целиком, и собирается при сравнении с каким-либо известным референтом, либо de novo. Фрагментный анализ ориентирован на разделение флуоресцентно-меченных продуктов амплификации, при проведении исследований вариабельных областей генома животных.
Секвенирование и фрагментный анализ
Секвенирование и фрагментный анализ iДНК-ПЛЕМстат ориентированы на получение сервиса в опеределении нуклеотидной последовательности полного генома животного или его фрагмента.
Фрагментный анализ ориентирован на разделени е флуоресцентно-меченных продуктов амплификации, при проведении исследований вариабельных областей генома животных.
Сверхдлинное секвенирование фрагментов генома
Секвенирование осуществляется на платформе для свердлинного секвенирования (до 40 000 п.н.) в ячейке прибора Pacific Biosciences II.
В стоимость входит осуществление самого секвенирования, с проверкой качества образца. Сохранение данных и их передача.
Стоимость указана за один биологический образец.
В стоимость не входят транспортные. накладные командировочные расходы.
В стоимость не входит выделение ДНК, подготовка и проверка качества образца, амплификация, праймерный мультиплекс, подбор паймеров и биоинформационные услуги, анализ данных и выбор мишеней.
Секвенирование полных геномов животных
Секвенирование осуществляется на современной платформе для геномного секвенирования класса Illumina, BGI/MSI, Ion TermoFisher (США).
В стоимость входит осуществление самого секвенирования, с проверкой качества образца. Сохранение данных и их передача.
Стоимость указана за один биологический образец.
В стоимость не входят транспортные. накладные командировочные расходы.
В стоимость не входит выделение ДНК, подготовка и проверка качества образца, амплификация, праймерный мультиплекс, подбор паймеров и биоинформационные услуги, анализ данных и выбор мишеней.
Фрагментное (целевое) секвенирование геномов DNA-SEQ
Секвенирование целевых фрагментов генома животных осуществляется на современной платформе для геномного секвенирования класса Illumina, BGI/MSI, Ion TermoFisher (США).
В стоимость входит осуществление самого целевого секвенирования, с проверкой качества образца. Сохранение данных и их передача.
Стоимость указана за один биологический образец.
В стоимость не входят транспортные. накладные командировочные расходы.
В стоимость не входит выделение ДНК, подготовка и проверка качества образца, амплификация, праймерный мультиплекс, подбор паймеров и биоинформационные услуги, анализ данных и выбор мишеней.
Фрагментное (целевое) секвенирование экзомов геномов RNA-SEQ
Секвенирование целевых фрагментов экзома генома животных осуществляется на современной платформе для геномного секвенирования класса Illumina или ION Termo Fisher (США).
В стоимость входит осуществление самого экзомного секвенирования (RNASEQ), с проверкой качества образца. Сохранение данных и их передача.
Стоимость указана за один биологический образец.
В стоимость не входят транспортные. накладные командировочные расходы.
В стоимость не входит выделение ДНК, подготовка и проверка качества образца, амплификация, праймерный мультиплекс, подбор паймеров и биоинформационные услуги, анализ данных и выбор мишеней.
Классическое секвенирование
Классическое секвенирование фрагмента животных осуществляется по Сенгеру на капиллярном секвенаторе Termo Fisher (США) или Nanophor (Россия).
В стоимость входит осуществление самого секвенирования, с проверкой качества образца. Сохранение данных и их передача.
Стоимость указана за один биологический образец.
Для проведения секвенирования возможно, но необязательно предоставление лидирующего олигонулеотида затравки. Тогда он синтезируется по вашему запросу индивидуально и его подбор и синтез оплачивается дополнительно.
В стоимость не входят транспортные. накладные командировочные расходы.
В стоимость не входит выделение ДНК, подготовка и проверка качества образца, амплификация, праймерный мультиплекс, подбор праймеров и биоинформационные услуги, анализ данных и выбор мишеней.
Анализ данных, сборка генома животных
Анализ данных последовательностей, полученных при помощи высокоэффективного параллельного секвенирования (NGS) на платформах класса Illumina, BGI/MSI, Ion TermoFisher, PacBio Biosciences (США).
В стоимость входит создание технического задания, целей секвенирования, получение и хранение данных, выбор генома и референтной его части, реализация процесса сборки и выравнивания последовательностей, анализа качества и воспроизводимости, поиска вариабельности в отношении референта.
В стоимость не входят накладные и командировочные расходы.
Реализация задачи не подразумевает безграничное хранение данных, если иное не предусморено ТЗ или проводимым проектом НИР (НТП).
