Целевое, фрагментное секвенирование генов животных-биоинформатика
Подбор праймеров для целевого секвенирования генов геномной ДНК и РНК в соответствии с пожеланиями заказчика.
Подбор праймеров осуществляется с учётом экзон-интронной структуры. Специфические олигонуклеотиды подбираются в соответствии с заданной длиной секвенирования на приборах класса iSeq, HiSeq, MySeq с перекрытием соседних областей.
Рекомендуется для коротких генов или фрагментов использовать более короткие фрагменты амплификации, а для секвенирования длинных генов длинные. Также в случае сборки генов de novo без данных референтного генома рекомендуется использовать длинные фрагменты амплификации.
Рекомендуется проводить секвенирование целевых панелей с покрытием не менее 100-500 для выявления редких вариантов изменчивости генов.
В стоимость включен подбор олигонуклеотидов и файл спецификация на 1 ген средней протяженности от 1000 п.н. в случае сложной структуры транскрипции - стоимость может быть увеличена. Работы осуществляются согласно техническому заданию, согласованному заранее.
В стоимость работ не входит стоимость заказанной панели праймеров, стоимость адаптеров, стоимость реактивов для амплификации и секвенирования, стоимость запуска приборов, но это может быть оговорено отдельно.
В стоимость не входят транспортные, накладные и командировочные расходы.