Консультации по статистической обработке фенотипических и биометрических данных
Консультации по статистической обработке фенотипических и биометрических данных, проведение ассоциативных исследований по поиску структурно-функциональных связей генома животных и фенотипического проявления наблюдаемого селекционного признака.
Полногеномный поиск ассоциаций (GWAS) — направление генетических исследований, связанных с исследованием ассоциаций между геномными вариантами и фенотипическими признаками. Под полногеномным поиском ассоциаций подразумевают поиск связей между однонуклеотидными полиморфизмами (англ. single-nucleotide polymorphism, SNP) и заболеваниями животных.
Основная цель GWAS заключается в идентификации генетических факторов риска, чтобы дать обоснованный прогноз о предрасположенности к заболеванию, а также в выявлении биологических основ восприимчивости к болезни для разработки новых стратегий профилактики и лечения.
В исследованиях такого типа обычно сравнивают геномы группы больных животных, имеющих разные фенотипы, с геномами контрольной группы, включающей в себя аналогичных по возрасту, полу и другим признакам здоровых особей.
С помощью GWAS можно сравнивать не только геномы пациентов, но и здоровых особей, имеющих разные проявления одного и того же фенотипического признака. Материалом для исследования являются образцы геномной ДНК каждого индивидуума, в которой с помощью микрочипов ищут SNP. Если удаётся выявить варианты геномов (точнее, совокупность аллелей), которые значимо чаще встречаются у особейс данным заболеванием, то говорят, что такой вариант связан (или ассоциирован) с болезнью. В отличие от методов, которые проверяют один или несколько конкретных участков генома, полногеномный поиск ассоциаций использует полную последовательность ДНК.
Следует отметить, что этот подход к исследованиям не выявляет мутации, ставшие причиной заболевания, а только более или менее значительную корреляцию с заболеванием или другим признаком.
Исследование не включает в себя расходы по сбору фенотипических данных, включает генотипирование на чипе средней плотности компании Illumina, построение первичной математической линейной модели и статистическую обработку данных.
Стоимость указана за голову животного не считая стоимости проживания и командировочных и транспортных расходов.